Nació el 14 de febrero de 1827 en la villa vizcaína de Elorrio. A los 15 años le dijo a su padre que quería ser cura, pero la economía familiar no era nada buena y tuvo que quedarse a trabajar en la carpintería. Permaneció así tres años, hasta que en otoño de 1845 ingresó en el Seminario de Logroño.

Durante dos años desempeñó tareas apostólicas en el seminario, como director espiritual y en varias parroquias de la ciudad. Como era muy alegre y se ejercitaba en cuerpo y alma con los demás, sus fieles empezaron a apreciarlo y apreciarlo plenamente.

Viajaron a Cádiz para tomar el barco a Manila y, tras seis meses aprendiendo la lengua annamesa, se trasladaron a Tonkin para dar a entender su fe, la actual Vietnam.

Escribió cartas a su madre, en euskera, explicándole lo que pasaba. Lo denunciaron y lo detuvieron, el resultado también era conocido: la pena de muerte. Fue canonizado en 1988 junto a otros 116 mártires vietnamitas.

Hoy día 4 de julio se celebra en Elorrio el día de Berrio Otxoa en su honor y tiene museo en el convento de Santa Ana.